Księgozbiór Książnicy Pedagogicznej, liczy ok. 205 000 woluminów, z tego 50 000 znajduje się na miejscu, a w magazynie zewnętrznym przy ul. Nowy Świat ok. 155 000.
Depozyt Kaliskiego Towarzystwa Przyjaciół Nauk, udostępniony w bibliotece, liczy blisko pobad 14 000 wol. zlokalizowany jest przy ul. Bankowej 9.
Księgozbiór w magazynach ułożony jest według kolejnych numerów – sygnatur (numerus currens), zgodnie z kolejnością ich wpisania do księgi inwentarzowej oraz formatów (ułożenia ich na półkach według wymiarów) celem oszczędzania miejsca, którego zaczyna brakować w pomieszczeniach magazynowych. Książki z magazynu można zamawiać przez katalog elektroniczny codziennie przez całą dobę. Zamówienia magazynowe do Wypożyczalni realizowane są na bieżąco w godzinach pracy Biblioteki.
Do głównych zadań Działu Magazynów i Konserwacji Zbiorów należy:
dbanie o utrzymanie księgozbioru w należytym porządku,
monitorowanie warunków przechowywania oraz stanu zbiorów,
wydzielanie zbiorów zniszczonych i zagrożonych patologią,
kwalifikowanie książek i czasopism do naprawy,
przyjmowanie nowych książek z Działu Gromadzenia, Uzupełnianiai Opracowania Zbiorów,
wykonywanie różnorodnych opakowań ochronnych dostosowanych do rodzaju zabezpieczanego obiektu oraz stanu jego zachowania, a także prac z zakresu galanterii introligatorskiej, do której zaliczamy: futerały, pudła, teczki, tuby,
dokonywanie drobnych napraw zniszczonych zbiorów przy użyciu specjalistycznych taśm i maszyn m. in. sklejarki, gilotyny introligatorskiej oraz laminarki.